I understand that both have almost the same meaning.
  But I was pointed out.
  Is this a preference issue, or is one prioritized?

  i.e
「リンゴマークがあるか確認します。」
「リンゴマークがあるかを確認します。」

I understand that both have almost the same meaning. 
But I was pointed out. 
Is this a preference issue, or is one prioritized? 
i.e.

「リンゴマークがあるか確認します。」
「リンゴマークがあるかを確認します。」